Мазепа яркими красками описывал перед московским правительством народное неудовольствие, поднимавшееся против него от этих «легкомысленных и непостоянных людей» за его верную службу России. Он хотел, очевидно, подогреть этими сообщениями признательность московского правительства ввиду неприятностей, падающих на верного гетмана за его верную службу Москве, но это была не очень умная тактика, так как предшествующий опыт показывал, что обыкновенно всякая верная служба московским правительством забывалась, если против гетмана возникало движение в самой Украине, и Москве не было расчета поддерживать гетмана. Но, вероятно, Мазепа не очень безнадежно смотрел на положение дел на Украине и полагал, что с московской помощью и своими компанейцами он сможет держаться, не заботясь о настроении народа. Между тем его верная служба московскому правительству действительно налагала на казачество и весь украинский народ «бремена неудобоносимые», и в силу этого у народа не только «отпадало сердце к великому государю», как говорили современники, то есть исчезало всякое доверие и расположение к московскому правительству, но и против гетмана, верного слуги «москалей», поднимались раздражение и гнев.Новое московское правительство царя Петра возобновило войну с Турцией и Крымом в 1695 г., и в продолжение четырех лет казацкое войско из года в год должно было ходить в походы по указаниям царя то на турецкие города, то против татар, а Украина одновременно сильно страдала и от татарских нападений из-за этой войны. Но, как оказалось потом, это еще было не самое худшее. Потом пошло хуже. Окончив войну с Турцией, царь Петр присоединился к войне Польши со шведами, чтоб открыть Москве дорогу к Балтийскому морю.

И снова, начиная с 1700 г., казацкое войско из года в год должно было предпринимать на свой счет, без всякого вознаграждения, далекие походы на север, где множество казаков погибало от непривычного климата, тяжелой службы, а кто уцелел, возвращался пеш и гол к тому же приходилось выносить всякие издевательства и истязания со стороны московских офицеров, распоряжавшихся казаками - их ругали, били, калечили, делали с ними что хотели. Кроме военной службы, казаков постоянно употребляли для разных тяжелых работ при постройке крепостей в 1706-07 годах огромное количество их употреблено было для работ при постройке новой крепости в Киеве, на Печерске, так как царь опасался похода шведов на Украину. Казаки должны были работать зимой и летом, под присмотром московских надсмотрщиков, обращавшихся с ними чрезвычайно грубо и жестоко. Кроме того, через Украину постоянно передвигались московские полки и команды, чрезвычайно обременявшие население, забиравшие всякие припасы, обходившиеся грубо не только с простым народом, но и со старшиной. Со всех сторон поднимались «плач и стенание» казачества и всего народа, и даже наиболее покорные московскому господству люди начали заявлять, что так дольше продолжаться не может.Два полковника, миргородский Апостол и прилуцкий Горленко, как более значительные и более имевшие смелости в сношениях с Мазепой, говорили ему: «Очи всех на тя уповают, и не дай Боже тебе смерти, останемся в такой неволе, что нас и куры загребут». А Горленко подтвердил это: «Как мы всегда молимся Богу за душу Хмельницкого, так мы и дети наши из рода в род будем душу и кости твои проклинать, если нас в свое гетманство оставишь в таком рабстве».Несомненно, все это было тяжело чувствовать самому Мазепе, а кроме того, возникали у него различные тревожные опасения. До сих пор он опирался на московскую помощь но в конце 1705 г. положение Москвы в шведской войне начало сильно ухудшаться.

Шведский король, безумно смелый и предприимчивый Карл XII, за это время покончил с другими участниками войны, королями датским и польским. Разгромив партию короля Августа в Польше, он добился избрания своего ставленника, а Августа принудил в 1706 г. отречься от польской короны, и так Петр остался один против этого страшного противника, приобретшего славу непобедимого воителя.Нужно было ожидать шведов и на Украине, а на Москву надежда была невелика. Когда Мазепа завел с Петром речь об угрожающей опасности со стороны шведов, царь решительно предупредил его, чтобы он не надеялся на его помощь: он не может обещать ему московского войска, так как оно нужно ему самому. Со своими же силами Мазепе нечего было и думать о борьбе с Карлом. Очевидно было, что если бы шведы только вошли в покинутую Москвой Украину, там немедленно поднялось бы восстание: население, раздраженное московскими притеснениями, наверное, присоединилось бы к шведам, да и на старшину трудно было положиться. Нужно помнить, что со шведами связано было воспоминание о прежних трактатах во времена Хмельницкого и Выговского, когда шведским протекторатом обеспечивалась свобода и независимость Украины. С ним связывались разные надежды, и они так и остались не разбитыми и не опороченными, лишь неисполненными, так как шведы вышли тогда из борьбы с Польшей. Теперь они шли на Украину, и старшина чувствовала, что на нее падает обязанность довести до конца дело, не доведенное ее предками - попытаться при шведской помощи освободить Украину от московской власти, так тяжело и безжалостно тяготевшей в последние годы над нею. С другой стороны, Мазепа не раз имел случай убедиться, что царская милость очень непрочна.

В беспокойной голове царя возникали все новые и новые проекты, и среди них очень часто появлялись различные комбинации, касавшиеся Украины. То он задумывал упразднить казацкое войско и ввести на Украине рекрутский набор. То думал образовать из Украины княжество для какого-нибудь нужного человека, например, для английского герцога Мальборо, через которого царь думал вовлечь в свои планы Англию. Петр даже уже выпросил у немецкого императора титул имперского князя для Мазепы, чтобы вознаградить его за потерю гетманства изготовлена была уже для него и грамота от императора и герб. Зная ближе Петра, Мазепа понимал, что если ему действительно встретится какая-нибудь выгодная комбинация с Украиной, то он не пожалеет ни гетманских заслуг, ни его испытанной верности. Нельзя было полагаться на него, нужно было самому промышлять о себе.